MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 chromosome

Total Repeats: 24382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018877	TATT	2	8	33	40	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018877	TTG	2	6	52	57	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018877	AGG	2	6	88	93	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018877	TAGA	2	8	1495	1502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018877	CTATTA	2	12	1548	1559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018877	CTA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018877	T	6	6	1566	1571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018877	ATTA	2	8	1578	1585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018877	TTTA	2	8	2843	2850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018877	TCT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018877	ATGT	2	8	6257	6264	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018877	AGG	2	6	6281	6286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018877	G	6	6	8770	8775	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018877	T	7	7	8791	8797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018877	ATA	3	9	8798	8806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018877	TA	3	6	8829	8834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018877	GA	3	6	8854	8859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018877	TTG	2	6	8880	8885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018877	ATA	2	6	8892	8897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018877	AT	3	6	8905	8910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018877	AAACA	2	10	8951	8960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018877	AAC	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018877	ATTTTT	2	12	8978	8989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018877	AACT	2	8	9002	9009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018877	GGC	2	6	9047	9052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018877	AAG	2	6	9100	9105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018877	GCG	2	6	9109	9114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018877	ATA	2	6	9187	9192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018877	GGC	2	6	9221	9226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018877	ATGG	2	8	9241	9248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018877	GCA	2	6	9368	9373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018877	CGC	2	6	9415	9420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018877	GTGA	2	8	9421	9428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018877	TGT	2	6	9454	9459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018877	GAA	2	6	9464	9469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018877	CAG	2	6	9537	9542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018877	ATT	2	6	9578	9583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018877	GC	4	8	9593	9600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018877	GGT	2	6	9602	9607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018877	AGA	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018877	GGA	2	6	9728	9733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018877	GAA	2	6	9992	9997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018877	GGT	2	6	10066	10071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018877	GTC	2	6	10080	10085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018877	TCGTG	2	10	10089	10098	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018877	CAT	2	6	10148	10153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018877	GGA	2	6	10192	10197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018877	ATC	2	6	10216	10221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018877	AC	3	6	10243	10248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018877	AC	3	6	10412	10417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018877	CAC	2	6	10427	10432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018877	AGCC	2	8	10475	10482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018877	GAT	2	6	10498	10503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018877	CCT	2	6	10554	10559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018877	TGA	2	6	10573	10578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018877	TCA	2	6	10586	10591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018877	TTTCGT	2	12	10607	10618	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018877	TTCAA	2	10	10632	10641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018877	GATAT	2	10	10660	10669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018877	CCA	2	6	10763	10768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_018877	GCCT	2	8	10802	10809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018877	AGG	2	6	10817	10822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018877	CCA	2	6	10847	10852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018877	T	6	6	10915	10920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018877	GTAA	2	8	11020	11027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018877	ATGGT	2	10	11072	11081	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018877	AGAC	2	8	11110	11117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018877	GGA	2	6	11145	11150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018877	GCG	2	6	11179	11184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018877	CGT	2	6	11292	11297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018877	AAC	2	6	11305	11310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018877	TC	3	6	11330	11335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018877	CGG	2	6	11354	11359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018877	GGA	2	6	11386	11391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018877	CACG	2	8	11716	11723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018877	GT	3	6	11989	11994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018877	AGC	2	6	12048	12053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018877	ACC	2	6	12126	12131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018877	TGG	2	6	12207	12212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018877	ACA	2	6	12357	12362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018877	ACC	2	6	12378	12383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018877	AGA	2	6	12421	12426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018877	GAG	2	6	12608	12613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018877	GA	3	6	12631	12636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018877	CT	3	6	12748	12753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018877	CTGAA	2	10	12836	12845	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018877	CGG	2	6	12857	12862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018877	TGG	2	6	13119	13124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018877	CCT	2	6	13215	13220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018877	GGT	2	6	13351	13356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018877	CGT	2	6	13546	13551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018877	CGT	2	6	13572	13577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018877	GAG	2	6	13595	13600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018877	GTT	2	6	13649	13654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018877	C	6	6	13722	13727	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_018877	GAT	2	6	13773	13778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018877	ATA	2	6	13855	13860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018877	TGA	2	6	13909	13914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018877	AG	3	6	13919	13924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018877	CT	3	6	13961	13966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018877	AT	4	8	15092	15099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018877	CTA	2	6	15133	15138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018877	ATA	2	6	15139	15144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018877	TA	3	6	16641	16646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018877	T	9	9	16678	16686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018877	CTC	2	6	18060	18065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018877	T	9	9	18077	18085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018877	AGT	2	6	18117	18122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018877	TAGT	2	8	18137	18144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018877	G	6	6	18203	18208	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018877	TGT	2	6	19799	19804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018877	AG	3	6	19812	19817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018877	TGGT	2	8	19822	19829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018877	ATCC	2	8	19855	19862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018877	TGGAA	2	10	19863	19872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018877	TA	3	6	19989	19994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018877	T	6	6	20005	20010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018877	TAAAA	2	10	20019	20028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018877	GGA	2	6	20029	20034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018877	TA	3	6	20036	20041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018877	TTTCC	2	10	21396	21405	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018877	ATTT	2	8	21411	21418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018877	TAG	2	6	21419	21424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018877	ATATT	2	10	21449	21458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018877	GGC	2	6	21519	21524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018877	CG	3	6	21531	21536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018877	CCT	2	6	21555	21560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018877	ACA	2	6	21574	21579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018877	TTTTA	2	10	21628	21637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018877	TTA	2	6	21676	21681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018877	GAT	2	6	21696	21701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018877	TCC	2	6	23471	23476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018877	ACT	2	6	23499	23504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018877	ATT	2	6	23521	23526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018877	AGCG	2	8	23542	23549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018877	AT	3	6	23581	23586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018877	CT	3	6	24140	24145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018877	T	6	6	24145	24150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018877	GTA	2	6	24190	24195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018877	TAAG	2	8	24915	24922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018877	GGAA	2	8	24977	24984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018877	GCA	2	6	24985	24990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018877	TCT	2	6	25000	25005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018877	TA	3	6	25088	25093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018877	T	6	6	25127	25132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018877	TAA	2	6	25175	25180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018877	ATA	2	6	25186	25191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018877	GAGG	2	8	25198	25205	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018877	AGG	2	6	26913	26918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018877	AATT	2	8	26919	26926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018877	TATTT	2	10	28132	28141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018877	GTT	2	6	28157	28162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018877	TTA	2	6	28163	28168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_018877	TTGTC	2	10	28214	28223	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_018877	GCA	2	6	29112	29117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_018877	GGT	2	6	29810	29815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_018877	GTC	2	6	29824	29829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_018877	TAT	2	6	47273	47278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018877	AGG	2	6	47309	47314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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